期刊简介

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  • 杂志名称:海南医学杂志
  • 主管单位:海南省卫生厅
  • 主办单位:海南省医学会
  • 国际刊号:1003-6350
  • 国内刊号:46-1025/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录:上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, CA 化学文摘(美), 知网收录(中), 万方收录(中)
海南医学杂志2013年第20期

骨肉瘤中DNAzymes针对ezrin mRNA作用靶点筛选及体外验证

张国如;王晋;王姚斐;陈运崇;杜秀藩

关键词:Ezrin, 靶点, DNAzymes, 二级结构
摘要:目的 对Ezrin mRNA的4个DNAzymes靶点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789通过体外实验进行验证,寻找佳的作用位点.方法 同时使用RNAdraw、RNAstructure和OligoWalk 3个程序对Ezrin mRNA的DNAzymes靶点进行了设计和筛选,对终选出的4个位点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789进行实验研究.结果 4个DNAzymes分别命名为Dz1655、Dz1751、Dz1766和Dz1789,酶切反应结果只有Dz1751在预期的位点成功切割了ezrin全长的mRNA,得到了128 bp和1633 bp两个片段,其他3个DNAzymes均未能有效地完成切割;反应后所剩留底物RNA中位点AU1751少,位点AU1751是DNAzymes切割ezrin mRNA的佳位点.结论 核酸二级结构联合热动力学参数可以大程度预测和设计DNAzymes针对ezrin mRNA的作用位点.